因應第五波疫情爆發及必要采取的社交距離措施，本地及跨境客運業界的經營環境受到沉重打擊。為協助應對當前的經營壓力，政府透過第六輪「防疫抗疫基金」向運輸業界提供以下補貼︰
（一）本地非專營公共巴士、學校私家小巴、本地出租汽車、跨境巴士（包括口岸穿梭巴士）及跨境出租汽車
每位合資格的本地非專營公共巴士、學校私家小巴、本地出租汽車、跨境巴士及跨境出租汽車登記車主，可獲每輛車一筆過港幣30000元的非實報實銷補貼。
運輸署已發信通知上述合資格的登記車主有關補貼安排的詳情，截止申請日期為6月30日。運輸署在完成核實車主所提交的數據後，將於1至2個月內以自動轉賬形式發放補貼。
（二）的士及紅色小巴
每位合資格的的士及紅色小巴登記車主，可獲每輛車一筆過港幣30000元的非實報實銷補貼。
運輸署4月1日起陸續發信通知各有關的士及紅色小巴的登記車主，透過電子平臺辦理登記領取補貼的詳情。運輸署在完成核實車主所提交的數據後，將於1至2個月內以自動轉賬形式發放補貼。
（三）綠色小巴
公共小巴（專線）服務客運營業證持有人可獲一筆過每輛綠色小巴港幣30000元的非實報實銷補貼。截至3月31日，運輸署已收到159份（即約九成七的持證人）申請，涉及3188部綠色小巴，並已陸續向完成申請審批的持證人發放相關的補貼。
（四）街渡
每位合資格街渡營辦商可獲一筆過每艘用於街渡航線的船只港幣20000元的非實報實銷補貼。運輸署已陸續發信通知各街渡營辦商有關一筆過補貼的安排。
（五）跨境渡輪
每艘合資格的跨境渡輪船只的營辦商可獲一筆過50萬元的非實報實銷補貼。海事處已發信通知各合資格的跨境渡輪營辦商有關補貼安排的詳情，並會在完成核實營辦商所提交的數據後，陸續安排發放補貼。
